Die Kompetenzzentren der OTH Regensburg stellen interdisziplinär ausge­richtete und fakultätsübergreifende Forschungseinheiten dar. Unter dem Dach der Zent­ren werden forschungsstrategisch relevante Themen institutionalisiert. Eine weitläufige Vernetzung der Forscherinnen und Forscher gewährleistet dabei eine entsprechende Tiefe, Breite sowie Kontinuität der behandelten Forschungsthemen. Diese Forschungseinheiten gibt es:

•  Combustion Engines and Emissions Control Laboratory - CEEC
•  Competence Center Software Engineering - CCSE
•  Historische Bauforschung - HB
•  Friedrich-Mielke-Institut für Scalalogie - FMIS
•  Innovationszentrum für Produktionslogistik und Fabrikplanung - IPF
•  Institut für Sozialforschung und Technikfolgenabschätzung - IST
•  LandUmbau
•  Laboratory for Safe and Secure Systems - LaS³
•  Mechatronics Research Unit - MRU
•  Nachhaltiges Bauen - KNB
•  Nanoanalytik und Halbleiterchemie - Nanochem
•  Sensorik-ApplikationsZentrum - SappZ